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祝贺!天昊微生物扩增子和基因组学联合分析助力客户骨质疏松研究见刊一区杂志《Frontiers in Microbiology》

发稿时间:2022-01-26来源:天昊生物

由华中科技大学同济医学院齐教授和黄琴教授研究团队在国际期刊《Frontiers in Microbiology》上发表最新了研究成果。研究者通过使用微生物扩增子测序和基因组学等技术,研究了中国汉族老年人群中常见的R-spondin/Wnt 信号基因变异、肠道菌群组成和骨质疏松症 (OP) 风险之间的关系,为OP的预防和治疗提供了新的视角。在本项研究中,研究者利用天昊生物目的区域定制靶向捕获测序SNPscan®通量SNP分型技术和微生物16S扩增子测序,进行了基因变异和肠道菌群组成分析。在恭喜客户取得好成绩的同时,让我们简单看下这篇文章。


英文题目:Integrative Analysis of LGR5/6 Gene Variants, Gut Microbiota Composition and Osteoporosis Risk in Elderly Population

中文题目:老年群体LGR5/6基因变异、肠道菌群组成与骨质疏松风险的整合分析

期刊名:Frontiers in Microbiology

发表时间:202111

影响因子:5.640/Q1

目的:本研究旨在探讨中国汉族老年人群中常见的R-spondin/Wnt信号基因变异、肠道菌群组成和骨质疏松症 (OP) 风险之间的关系。实验设计:研究者在发现阶段( n = 400, 228 OP 患者)使用目的区域定制靶向捕获二代测序,在验证阶段(n = 768, 356 OP 患者)使用SNPscan®高通量SNP分型技术对参与者进行基因分型检测,并对基因型-OP进行关联分析。利用16S rRNA扩增子测序对与OP相关的肠道菌群情况进行了检测。结果:研究发现LGR6基因中 rs10920362LGR5基因中rs11178860的遗传变异与 OP 风险显著相关。几个微生物类群与多个骨骼部位的低骨密度(BMD)和 T值相关。调整混杂因素后,rs10920362  BMD 相关微生物群之间的关联仍然具有显著性。rs10920362 CT/TT基因型与较低的放线菌、双歧杆菌相对丰度关联。结论:本研究结果表明,LGR6的变异位点可能通过肠道菌群修饰与 OP 发病机制相关。宿主遗传学和肠道微生物组之间的关系为 OP 的预防和治疗提供了新的视角。

骨质疏松症 (OP) 是一种代谢性骨病,其特征是低骨密度 (BMD)和骨组织的微结构退化。在人体中,骨代谢是一个受宿主遗传因素、环境因素和生活方式影响的严格复杂调控下的动态过程。越来越多的全基因组关联研究 (GWAS)  SNP 研究表明,R-spondin/wingless 相关整合位点 (Wnt) 信号通路中的基因与 BMD 减少、OP 和骨折的风险相关。富含亮氨酸的重复序列含有 G 蛋白偶联受体 5/6 (LGR5/6 R-spondin/Wnt 信号通路中 OP 易感基因中研究最彻底的成员。LGR5/6作为 R-spondin 家族的受体,通过增强 Wnt/b-catenin 信号传导来调节骨代谢。除了遗传对 OP 的影响外,来自人类和动物研究的各种数据表明,肠道微生物群在调节骨代谢中起着不可或缺的作用。然而,目前还没有关于宿主遗传学、肠道微生物群和OP风险之间相互关系的信息。因此,确定特定遗传变异与涉及该过程的微生物之间的关联是非常重要的。本研究在某种程度上试图填补这一知识空白,即 R-spondin/Wnt 信号网络遗传变异通过控制肠道微生物群组成导致 OP 风险。因此,我们采用目的区域定制靶向捕获测序技术、SNPscan®高通量SNP分型技术16S核糖体RNArRNA)基因高通量测序技术,对中国汉族人群LGR5/6基因变体、肠道菌群组成和OP风险进行综合分析。